零背景平末端快速克隆試劑盒 T4原理
零背景平末端快速連接試劑盒是一種優(yōu)良的zi殺基因陽(yáng)性選擇克隆系統(tǒng),可以高效克隆平末端 PCR 產(chǎn)物和任何具有平末端的DNA 片段初步建立。該試劑盒對(duì)磷酸化或非磷酸化的 DNA 片段都有效堅實基礎。零背景平末端快速克隆試劑盒 T4原理
ZERO-Blunt零背景平末端快速克隆試劑盒
零背景平末端快速克隆試劑盒 T4原理
目錄號(hào):42018
試劑盒組成、儲(chǔ)存機構、穩(wěn)定性:
試劑盒組成 | 20次(42018-20) | 40次(42018-40) |
pZERO-Blunt Vector(40ng/ml) | 20 ml | 40 ml |
1K bp Control(40ng/ml) | 5 ml | 5 ml |
2 ′ Quick Ligation Buffer | 100 ml | 200 ml |
T4 DNA ligase, 5U/ml | 20 ml | 40 ml |
pZERO-Blunt Forward Sequencing Primer (10µM) | 100 ml | 200 ml |
pZERO-Blunt Reverse Sequencing Primer (10µM) | 100 ml | 200 ml |
-20℃儲(chǔ)存非常激烈,6個(gè)月內(nèi)不影響使用效果。
v 產(chǎn)品介紹:
零背景平末端快速連接試劑盒是一種優(yōu)良的zi殺基因陽(yáng)性選擇克隆系統(tǒng)更適合,可以高效克隆平末端 PCR 產(chǎn)物和任何具有平末端的DNA 片段技術交流。該試劑盒對(duì)磷酸化或非磷酸化的 DNA 片段都有效。 陽(yáng)性選擇載體和插入片段連接僅需 5 分鐘即可獲得超過(guò) 95%的陽(yáng)性重組克隆引人註目。由具有校正活性的聚合酶(如:Pfu polymerase)擴(kuò)增的平末端 PCR 產(chǎn)物可直接連入克隆載體關註。連接產(chǎn)物可直接轉(zhuǎn)化常用的大腸桿菌菌株。
試劑盒提供一個(gè)新穎的zi殺基因陽(yáng)性選擇克隆載體pZERO-Blunt建設。該載體含有致死的zi殺基因(內(nèi)含多克隆位點(diǎn))共同,當(dāng)載體與片段連接成功,zi殺基因無(wú)法正確表達(dá),包含重組子的細(xì)胞可以正常生長(zhǎng)在此基礎上;當(dāng)載體與片段連接不成功,載體自連后zi殺基因正確表達(dá)探索創新,包含自連空載體的細(xì)胞無(wú)法存活開展,即“零ZERO"背景。這種陽(yáng)性篩選策略無(wú)需藍(lán)白斑篩選前來體驗,極大地加速了克隆篩選進(jìn)程簡單化。
為方便酶切作圖和插入片段基因操作實現了超越,pZERO-Blunt克隆載體的多克隆位點(diǎn)兩側(cè)各包含一個(gè)BglII識(shí)別序列。此外開拓創新,該載體含有T7啟動(dòng)子確定性,可用于體內(nèi)或體外轉(zhuǎn)錄、插入片段測(cè)序等研究順滑地配合。
操作步驟:
1. 連接反應(yīng)的準(zhǔn)備:
平末端PCR產(chǎn)物或者酶切后平末端片段可以通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳分離回收(使用長(zhǎng)波紫外光下切膠或者可見(jiàn)光透射切膠避免DNA損傷造成連接失敻油晟?。Ec載體的摩爾比是 3:1上高質量。本公司生產(chǎn)的DNA產(chǎn)物快速純化回收試劑盒對(duì)70bp以上的DNA片段能很好地進(jìn)行回收精準調控。
2. 快速連接反應(yīng):
1) 在一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的10 ml連接反應(yīng)體系中,加入1 ml 40ng pZERO-Blunt 載體建設應用、X ml PCR產(chǎn)物(在通常狀況下優化程度,沒(méi)有必要對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行精確定量,一般PCR產(chǎn)物與載體的摩爾比優(yōu)化至1:1~10:1就可以得到良好結(jié)果應用的因素之一,推薦3:1基礎,見(jiàn)附錄)、5ml 2 ′ Quick ligation Buffer和0.9ml 的T4 DNA Ligase實踐者,其余用滅菌水補(bǔ)足管理。
反應(yīng)按以下體系進(jìn)行:
5ml | 2 ′ Quick Ligation Buffer |
1ml | pZERO-Blunt 載體 |
Xml | 純化后的PCR產(chǎn)物/或者1ml 1000bp control |
Yml | 滅菌水 |
0.9ml (5 Weiss Units/ml) | T4 DNA Ligase |
Final Volume | 10ml |
一般最后加入T4 DNA Ligase。
2) 22℃連接5-10分鐘(一般可在PCR儀器完成)豐富。
通常推薦22℃連接5-10分鐘 ,>3kb長(zhǎng)片段連接可以延長(zhǎng)至30分鐘。不推薦超過(guò)30分鐘善於監督,超過(guò)可能降低轉(zhuǎn)化子數(shù)量大局。
3) 冰上冷卻,然后轉(zhuǎn)化或貯存于-20℃數據。
3. 轉(zhuǎn)化:
1) 100ml感受態(tài)細(xì)胞效率和安,置于冰上,wan全解凍后輕撣幾次將細(xì)胞均勻懸浮邁出了重要的一步。
2) 加入4-5ml連接液(最多可全部加入產能提升,只要連接液體積不超過(guò)感受態(tài)細(xì)胞體積的1/10),輕輕混勻品牌。冰上放置30分鐘適應能力。
3) 42℃水浴熱激90秒。冰上放置2~3分鐘節點。
4) 加500ml LB或者SOC培養(yǎng)基(不含抗生素)快速增長,37℃ 150 rpm振蕩培養(yǎng)60分鐘。
5) 將200ml細(xì)菌涂布在氨芐青霉su(100mg/ml)平板上。
涂布細(xì)菌的用量依連接的效率及感受態(tài)細(xì)胞的感受率而進(jìn)行適當(dāng)?shù)恼{(diào)整通過活化,如果 預(yù)計(jì)的克隆較少競爭力,可通過(guò)離心(4,000rpm競爭力,2 分鐘)后吸除部分培養(yǎng)液持續創新,留下適量的培養(yǎng)基懸浮菌體后取全部或者適量涂布于一個(gè)平板中(涂布剩余的菌液可以擱在4度保存重要作用,第2天如果轉(zhuǎn)化菌落數(shù)量少,可將剩余菌液全部涂一個(gè)新培養(yǎng)板)處理。
6) 平板在37℃下正向放置1小時(shí)以吸收過(guò)多的液體攜手共進,然后倒置培養(yǎng)過(guò)夜。
5 篩選:
1). 常規(guī)檢測(cè):將得到的菌落接種 1-5 ml LB(含有終濃度為 100mg /ml 的氨芐青霉su)培養(yǎng)基自然條件,37℃搖床振蕩培養(yǎng)過(guò)夜,保存菌種后提取質(zhì)粒,應(yīng)用 PCR 或酶切方法鑒定插入片段是否正確體系流動性。
2). 快速檢測(cè):挑取菌落直接進(jìn)行PCR檢測(cè)(可參見(jiàn)分子克隆第3版本或者參考本公司CV05-通用T載體菌落PCR鑒定試劑盒說(shuō)明書(shū))。
3). 測(cè)序鑒定:使用試劑盒自帶引物或者T7啟動(dòng)子引物測(cè)序確定是否含有目的克隆深度。
本試劑盒自帶測(cè)序引物(也用于菌落PCR鑒定引物):
Forward sequencing primer, 23-mer | 5’-CGACTCACTATAGGGAGAGCGGC-3’ |
Reverse sequencing primer, 24-mer | 5’-AAGAACATCGATTTTCCATGGCAG-3’ |
v 附錄:
e 如何計(jì)算連接反應(yīng)中需要的PCR產(chǎn)物的量?
一般PCR產(chǎn)物與載體的摩爾比優(yōu)化至1:1~10:1(推薦3:1)就可以得到良好結(jié)果助力各行,可采用以下公式:
[加入載體的量(ng)×插入片段大小(kb)÷載體大袔砣轮悄?。╧b)]×插入片段和載體的摩爾比=插入片段的量(ng) 例如:插入片段和載體連接的摩爾比例為3:1互動互補,如連接反應(yīng)中加入載體40ng,插入片段大小為500bp自主研發,這時(shí)應(yīng)加入插入片段的量為[40ng載體×0.5kb插入片段÷2.974kb載體]×3/1=20.2ng力度。
零背景平末端快速克隆試劑盒 T4原理